如果雨水淹进加油站，赔偿问题需要综合多方面因素来确定。首先要明确雨水淹进加油站的原因。
如果是由于加油站自身的排水设施不完善、建筑设计缺陷等加油站自身原因导致的，加油站需要自行承担损失。
如果是因为市政排水系统故障、暴雨等自然灾害超过了正常防范能力等外部原因导致的，情况会较为复杂。如果市政排水系统存在长期维护不善等问题，市政部门可能需要承担一定责任。
对于因雨水淹没造成的直接经济损失，如加油机、储油罐、油品的损失，加油站可以向相关责任方主张赔偿。
如果加油站购买了相应的商业保险，如财产险等，也可以依据保险合同向保险公司申请理赔。
在这种情况下，主要涉及的法律包括《民法典》中的侵权责任相关规定。如果能够确定侵权方，被侵权方有权依据法律要求侵权方承担侵权赔偿责任。对于自然灾害等不可抗力因素，法律通常规定在一定条件下可以免除责任，但需要严格界定不可抗力的构成要件。对于保险合同，双方应当按照合同约定履行各自的权利和义务。如果保险公司拒绝合理理赔，加油站可以依据《保险法》通过法律途径维护自身权益。同时，如果涉及市政部门的责任，需要通过调查和相关证据来确定其是否存在过错以及过错程度，并据此确定责任分担比例。
